Il cadavere di un uomo viene ritrovato in una cisterna biologica. Nel corso delle indagini, Temperace si trova a lavorare fianco a fianco con un nuovo tirocinante, il dottor Rodolfo Fuentes (interpretato da Ignacio Serricchio, "Febbre d'amore", "The Bay", "Le streghe dell'East End"). Cubano, Fuentes ha praticamente le stesse credenziali accademiche della Brennan, ma i suoi titoli non sono equiparabili negli Stati Uniti, motivo per cui è costretto a un praticantato di fatto inutile. Il corpo della vittima presenta numerosi segni di lotta. Un tatuaggio ne permette l'identificazione: si tratta di Benny Jergeson, da poco uscito di galera sulla parola. La lista dei sospettati include Georgia Grace (Dendrie Taylor, "Luann in "Sons of Anarchy"), il capo di Benny, Graham Breslin (Chris Coy, "The Walking Dead", "Banshee"), camionista con un conto in sospeso con la vittima, e Horatio Mancini (Shahine Ezell), compagno di galera di Benny. Nel frattempo, Booth e Brennan devono decidere se dare o meno alla piccola Christine una qualche educazione di tipo religioso.