Il cadavere di un operaio viene rinvenuto nel sottosuolo di New York durante alcuni lavori di scavo a seguito dell'esplosione avvenuta in un tunnel. L'autopsia del corpo rivela però che l'uomo era già morto per asfissia prima dello scoppio. Mac e Danny cercheranno di scoprire cosa è successo veramente, mentre Stella e Aiden indagano sulla morte di una ragazza di sedici anni trovata strangolata.