In seguito a una soffiata anonima, Adam, alla guida della sua auto, viene fermato dalla polizia e dentro il suo baule viene trovato il corpo di Hideki Tashiro. McGarrett e Grover si mettono subito al lavoro per scagionare Adam e scoprire chi l'abbia incastrato. Del sangue ritrovato sul corpo di Hideki rivela una verità sconcertante: Adam ha una sorellastra e sembra che sia lei ad aver orchestrato tutti i recenti avvenimenti. Nel frattempo Tani e Junior, come parte del loro addestramento, vestono i panni di due agenti di polizia di pattuglia. Danny, invece, è alle prese con Brooke, una sua vecchia conoscenza di quando era un agente a Jersey. Insieme ripercorrono tutta la storia che ha portato il misterioso uomo del centro di quarantena a sparare a Danny.