Un capitano della Marina, pedinato nel tragitto tra casa e ufficio, muore nella colluttazione con un uomo che gli ruba il portatile, contenente informazioni sensibili sui membri dell'NCIS. Si scopre che il mandante del furto è Hassan Sayegh (Pezh Maan), lo zio libico di Phineas (Jack Fisher), il ragazzino vicino di casa di Gibbs, che già in passato aveva cercato di rapire il nipote. Il pericoloso gangster stavolta ha assoldato più uomini per arrivare a Phin, poiché suo figlio ha una grave forma di leucemia che necessita di un urgente trapianto di midollo da parte di un familiare. Nel frattempo, Torres e Bishop, sotto il fuoco di domande di Palmer e Kasie, infine decidono che è giunto il momento di discudere dei sentimenti che provano l'uno per l'atra.