Christopher (David Sutcliffe) rivela a Lorelai (Lauren Graham) di avere ricevuto una lettera di Sherry, che dichiara di avere finalmente compreso quanto sia grave l’avere abbandonato la figlia; essendo assolutamente decisa a ricucire il rapporto tra lei e la piccola GiGi, Sherry chiede a Christopher di poter avere per un po' la figlia con lei a Parigi. Lorelai, stupita dal fatto che Christopher sia disposto ad accettare la proposta dell’ex moglie, finisce per litigare con lui. Per via di un importante appuntamento di lavoro, Logan (Matt Czuchry) si presenta a sorpresa a Stars Hollow; inizialmente Rory (Alexis Bledel) è felice della visita inattesa, ma presto si rende conto di avere ben poco in comune con il nuovo ambiente lavorativo di Logan; la cosa meno piacevole per Rory sarà scoprire che Bobby, uno dei soci del fidanzato, è in realtà una ragazza molto affascinante. Nel frattempo a Stars Hollow c'è da risolvere un bel problema: l'aria è pregna di nauseabondo tanfo causato da un carico di sottaceti fuoriusciti da un vagone di un treno merci deragliato qualche giorno prima...