Il passato di Steve torna a bussare alla sua porta. McGarrett scampa a un attentato alla sua vita. Poco dopo riceve una chiamata dal suo mentore Joe White (la guest star Terry O'Quinn). L'uomo voleva metterlo in guardia. Qualcuno ha preso di mira i membri della squadra Seal, di cui Steve faceva parte, tempo prima impegnata in una missione in Marocco. Chi è e perché lo sta facendo? McGarrett è convinto che qualcuno li abbia venduti, nello specifico punta il dito contro l'agente Greer (Rochelle Aytes). Lei era in Marocco con loro, conosceva le loro identità e ha un conto da saldare: diventata informatrice per il governo cinese, infatti, è stata smascherata proprio da Steve.