L’aereo che trasportava gli undici detenuti ammara in circostanze misteriose e i detenuti fuggono. Si scatena una caccia tra le varie agenzie, tra cui l’NCIS per recuperare i più pericolosi. Gli agenti affiancati da Sam Hanna cercano un bandito di nome “il chimico” ma ignorano che tra gli evasi ci sia un soggetto ancor più temibile…