Mentre Kensi (Daniela Ruah) e Deeks (Eric Christian Olsen) sono alle prese con l'adozione, la squadra viene incaricata di seguire un nuovo caso, un'aggressione a sfondo razziale. Craig Tanaka (Cary-Hiroyuki Tagawa), un anziano sottotenente di origini giapponesi, che ha servito l’America durante la guerra del Vietnam, viene brutalmente picchiato da due uomini mentre sta pacificamente pescando sulla spiaggia. Molto probabilmente si tratta di un crimine d’odio a sfondo razziale, ma la squadra deve riuscire a dimostrarlo. Il figlio del sottotenente, il detective della Polizia Jack Tanaka (Christopher Sean), svolge un’indagine parallela, all’insaputa dell’NCIS. Spinto da spirito di vendetta, Jack finirà per oltrepassare i limiti. Nel frattempo, mentre Fatima e Rountree esprimono il desiderio di avere un ufficio loro - e Kilbride, a suo modo, li accontenta -, scopriamo che Callen e Anna si stanno frequentando.