Il Volo 19 della Everglades Airlines, proveniente dal Brasile, precipita nei bayou di New Orleans con a bordo tre sottufficiali della Marina. Non ci sono superstiti e la causa dell’incidente non è chiara. L’NCIS indaga sul caso insieme a molte altre unità investigative, tra cui l’FBI che è convinta che ci sia lo zampino del cartello Ciudad Natal. Quando Loretta esegue l'autopsia sui piloti, scopre che qualcuno gli ha sparato. Nel frattempo, LaSalle e Percy si occupano di selezionare i candidati per trovare il sostituto di Brody.