Il magazzino prove di Kowalski viene messo sottosopra in seguito a un furto, l’evento è un vero trauma per l’anziano agente che rassegna le sue dimissioni. L’indagine segue la pista dei trafficanti di cocaina a cui l'NIS sta dando la caccia, ma si scopre che la realtà è molto più complicata di quanto appaia all'inizio. Nel frattempo, Lala (Mariel Molino) si apre con Gibbs (Austin Stowell) e Kowalski fatica ad andare avanti.